刑事案件的侦查是由机关进行的，法律另有规定的除外。除以下特殊情况外的刑事案件应由机关立案管辖：1、由人民直接受理，不需要经过侦查的自诉案件；2、由人民直接立案侦查的案件；3、由保卫部门负责侦查的内部发生的刑事案件；4、由监狱立案侦查的罪犯在监狱内犯罪的案件。
【法律依据】
《刑事诉讼法》第十九条刑事案件的侦查由机关进行，法律另有规定的除外。人民在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，可以由人民立案侦查。对于机关管辖的国家机关工作人员利用职权实施的重大犯罪案件，需要由人民直接受理的时候，经省级以上人民决定，可以由人民立案侦查。自诉案件，由人民直接受理。